本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起
以DNA存储技术为核心,人工合成可以编码数字信息的DNA序列,并能进行稳定存储、读取和恢复原
DNA存储系统主要包括写入、存储和读取三大组成部分,系统参考架构见图1。
将二进制数据写入DNA存储媒体的过程被称为信息写入,信息写入主要包括编码和合成两大模块。
编码是将数字文件中的二进制数据提取出来,并按一定规则转换成为DNA碱基序列。
合成是通过化学原理或生物酶法原理,利用柱式合成、点阵芯片、半导体芯片等方式根据编码步骤
a)考虑DNA分子序列的受限限制进行映射的算法,包括Church编码算法、Goldman编码算法、
b)将两比特转化为一个碱基,然后增加筛选过滤步骤的编码算法,包括DNAFountain喷泉码和
不同类型算法性能不同、生成序列特性不同、隐私性及稳健性不同。待存储数据的编码算法选择可
采用合适的技术或算法添加额外的校验数据,对原始数据进行数学变换使之能够应对DNA存储过程
进行序列筛选以适应DNA分子的生化特性,如:无均聚物、平衡的GC含量、无复杂二级结构、无生
为保障DNA存储中的加密与数据安全,可根据存储数据的隐私性要求,对于编码环节进行加密,实
DNA合成环节的主要功能是完成DNA序列合成。DNA的合成按原理一般分为化学法合成和生物法合成。
化学法合成是主流成熟方法,包括一代合成(柱式)和二代合成(芯片)。生物法合成即三代合成
受限于高通量合成DNA序列的长度限制,为适应高通量长片段测序技术的要求,将合成的短DNA片段
封装分为物理封装和生物封装。物理封装即通过低温密封、矿化、无机物密封、固体胶囊等形式进
保存分为体外保存和体内保存。当体外保存DNA分子时,可采用干粉、溶液、纳米颗粒等形式保存。
将保存在不同存储媒体中的DNA序列进行测序获得DNA片段的碱基排列顺序,并将碱基序列转换为二
进制数据从而得到存储的文本文档、图片和声音文件等数据的过程称为信息读取。信息读取过程主要包
通过探针、PCR等方式抽取目标DNA以实现随机索引、重复获取以及快速预览功能。
测序是获得利用多重PCR分子等方式获取的编码DNA分子片段的碱基序列,即该片段中腺嘌呤A、胸
DNA测序技术主要包括Sanger测序法、高通量测序技术和单分子测序技术。
高通量测序技术主要基于可逆末端终止法、连接测序法、焦磷酸测序法和联合探针锚定聚合测序法。
单分子测序技术主要基于单分子荧光测序法、单分子纳米孔测序法和单分子晶体管测序法。
目前技术最为成熟的是高通量测序技术,已经能够实现高通量、高准确性和低重复序列率的性能。
解码环节的错误纠正是确保信息读取正确率的最后一环,为了纠正DNA存储过程中出现的插入、删
DNA存储系统工作流程一般可分为4个主要步骤,包括编码、合成、贮存、测序和解码:
a)编码:将数字文件中的数据提取出来,并按一定规则转换成为DNA碱基序列(包括但不限于自
b)合成:通过化学原理或生物酶法原理,利用柱式合成、点阵芯片、半导体芯片等方式根据编码
c)贮存:通过物理封装或生物封装方式,将携带信息的DNA分子保存于体外或体内;
d)测序:通过利用如多重PCR、生物素-亲和素序列特异性磁珠捕获等方式,完成全部或部分编
码DNA分子的获取,将获取的DNA分子通过Sanger测序、高通量测序、单分子测序等方式进
e)解码:对测序获得的DNA序列进行信息分析,根据编码规则对DNA碱基序列进行解码并得到原
根据2023年3月20日中国电子学会标准化工作委员会主任办公会立项同意,团体标
准《生物数字融合脱氧核糖核酸(DNA)存储系统参考架构》由中国电子技术标准化研究院
提出并主办,由中国电子技术标准化研究院、中国电子学会归口,计划编号为:JH/CIE360
本文件的编制组由中国电子技术标准化研究院、深圳华大生命科学研究院、哈尔滨工
业大学、北京大学、上海近观科技有限责任公司、上海交通大学医学院附属仁济医院、上海
市计量测试技术研究院、华中科技大学、东南大学、华北电力大学、上海国际人类表型组研
2023年3月至5月,启动标准立项工作。中国电子技术标准化研究院对国内DNA存储
技术及产业现状进行调研,初步形成标准草案并征集了一批参编单位共同完善标准,明确立
2023年3月,中国电子技术标准化研究院在北京完成立项答辩,经审核通过立项,并
2023年4月-2023年10月,中国电子技术标准化研究院对于标准草案进行完善,同时
对国内DNA存储相关专家和项目课题组专家进行一对一调研,完成调研技术产业报告,根据
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