本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。
以DNA存储技术为核心,人工合成可以编码数字信息的DNA序列,并能进行稳定存储、读取和恢复原始信息的系统。
DNA存储系统主要包括写入、存储和读取三大组成部分,系统参考架构见图1。
将二进制数据写入DNA存储媒体的过程被称为信息写入,信息写入主要包括编码和合成两大模块。
编码是将数字文件中的二进制数据提取出来,并按一定规则转换成为DNA碱基序列。
合成是通过化学原理或生物酶法原理,利用柱式合成、点阵芯片、半导体芯片等方式根据编码步骤获得的DNA序列进行从头人工合成。
考虑DNA分子序列的受限限制进行映射的算法,包括Church编码算法、Goldman编码算法、Grass编码算法、Blawat编码算法等;
将两比特转化为一个碱基,然后增加筛选过滤步骤的编码算法,包括DNAFountain喷泉码和Yin-Yang双编码算法等。
不同类型算法性能不同、生成序列特性不同、隐私性及稳健性不同。待存储数据的编码算法选择可根据以下特征进行选择:
采用合适的技术或算法添加额外的校验数据,对原始数据进行数学变换使之能够应对DNA存储过程中出现的错误。
进行序列筛选以适应DNA分子的生化特性,如:无均聚物、平衡的GC含量、无复杂二级结构、无生物活性序列等。
为保障DNA存储中的加密与数据安全,可根据存储数据的隐私性要求,对于编码环节进行加密,实现DNA编码高效、隐私。
DNA合成环节的主要功能是完成DNA序列合成。DNA的合成按原理一般分为化学法合成和生物法合成。
化学法合成是主流成熟方法,包括一代合成(柱式)和二代合成(芯片)。生物法合成即三代合
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